Можно ли настроить Sugar CRM на автоматическое создание backup Sugar и backup самой базы данных?

Это проще сделать сторонними программами.
Если SugarCRM установлена на системе Linux, то дамп базы через mysqldump, а каталог с /var/www/sugarcrm/ можно кидать в архив по расписанию.